2011年学校实行校院二级财务管理改革，财务与会计学院积极响应，在总结往年来财务管理工作经验的基础上，开展了学院二级理财的配套改革。
一、加强了学院财务制度建设。2011年7月学院制定了新的绩效岗及业绩增长津贴分配办法，修订了学院现有的财会制度，并在二级教代会上讨论通过，以制度建设来保证各项经费使用的高效、公平、公正。
二、学院设立了会计岗位，对经费实行分类管理。为确保学院财务工作按学校的要求执行，采取一些做法：第一，年初编制预算。行政经费预算由办公室主任编制；绩效及业绩增长津贴在每学期开学前作估算，使每月发放津贴尽可能均衡合理，年终进行决算。第二，完善学院内部控制，实行支出与审核相分离。行政经费开支除了经办人员签字外，要由办公室主任统一审核，学院院长签字；教师的岗位、业绩增长津贴，由相关管理人员按教代会通过的分配办法先行计算课时、岗位津贴，然后由学院会计再行复核、确认，最后由学院院长签字；各类专项经费，按学院制度规定的比例由直接参与者与全体教师共同享用，即经办人签字、项目负责人复核、学院院长签字。第三学院会计负责监督各项费用是否专款专用，即来源与用途是否相符合，负责与财务处沟通，将财务处的最新政策与制度传达到学院院长及教师那里。
三、坚持实行学院财务信息公开透明。将绩效及业绩增长津贴计算办法公开，教师可以查看、审核、监督；学院各项经费预算和决算向教职工公开；加强与教师的沟通、解释工作，将可能出现的矛盾消灭在萌芽中。重要的财务收支和预算外事项通过党政联席会的方式确定。可以说，学院二级理财的制度化和公开化是学院团结和谐的一个保障基础。